Il Museo Casa de Portinari intraprende molte azioni per conservare il patrimonio storico e artistico che è sotto la sua responsabilità. Tale patrimonio è costituito dagli edifici del museo-casa, dai dipinti murali e da poco più di 600 oggetti, tra cui disegni di Candido Portinari, mobili, abiti, utensili domestici e personali, strumenti, tubetti di colore, pennelli e fotografie.
La conservazione della casa, della cappella e degli annessi avviene attraverso un lavoro costante di ispezione e di manutenzione di tetti, grondaie, pareti, pavimenti, porte e finestre, per evitare o ridurre il deterioramento degli edifici, che avviene principalmente per effetto di piogge e venti. Le cure per gli oggetti sono varie e dipendono dai materiali di cui sono fatti, che possono essere metallo, porcellana, legno, carta, tessuto o una combinazione di essi. In generale, tutti gli oggetti ricevono pulizia, protezione contro la luce solare, il calore, l’umidità, i funghi, gli insetti, rotture e furti.